血浆/血清 RNA 纯化试剂盒
用于快速、轻松地从血浆/血清样品中纯化循环 RNA 和外泌体 RNA
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血浆/血清 RNA 纯化试剂盒
用于快速、轻松地从血浆/血清样品中纯化循环 RNA 和外泌体 RNA
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图 1.从不同容量的血浆中纯化循环 RNA。Norgen 血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒用于从 50 µL、100 µL 和 200 µL 经 EDTA 采集的血浆中纯化循环 RNA。然后将 3 μL 纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以检测 miR-21(图 1A)和看家 5S rRNA 转录本(图 1B)。随着样本输入量的增加,miR-21(图 1A)和 5S rRNA 转录本(图 1B)的相对量呈线性增加。
图 2.将纯化的循环 RNA 洗脱到不同的洗脱体积中。Norgens 血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒用于从用 EDTA 采集的 200 µL 血浆中纯化循环 RNA,洗脱液分别为 10 µL、15 µL 和 25 µL。然后将 3 μL 纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以检测 miR-21(图 2A)和看家 5S rRNA 转录本(图 2B)。随着洗脱体积的增加,miR-21(图 2A)和 5S rRNA 转录本(图 2B)的相对含量也在增加,这表明血浆循环 RNA 在极低的洗脱体积内得到了有效浓缩。
图 3.从血浆中有效、一致地检测 miRNA。Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒能有效地从血浆中分离 miRNA。使用 Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化 迷你试剂盒、竞争对手 Q 的试剂盒和竞争对手 E 的试剂盒从 200 µL 血浆中分离循环 miRNA。使用竞争对手 A 的试剂盒从 600 µL 中分离循环 miRNA。使用 miR-21 的特异性引物进行了干环 RT-q 聚合酶链式反应。简而言之,使用 Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒(竞争对手 Q 的试剂盒)纯化的 15 µL RNA 中的 1 µL,以及使用竞争对手 E 的试剂盒和竞争对手 A 的试剂盒纯化的 50 µL RNA 中的 3.3 µL,然后使用 miR-21 茎环反向引物进行 20 µL 反转录。在 20 µL 的实时聚合酶链式反应中使用了 3 µL 的反转录产物和引物来检测人类 miR-21。与其他分离方法相比,Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒对 miR-21 转录本的回收率最高,也最稳定。使用 Norgen 试剂盒从 200 µL 血浆中回收的 miRNA 高于使用竞争对手 A 试剂盒从 600 µL RNA 中纯化的回收率。
图 4.对低至 50 µL 血浆的小 RNA 进行测序。Norgen Biotek 开发了一种有效的管道,可对小体积血浆/血清进行小 RNA 测序。使用 Norgen 已获专利的样本制备技术,可从少至 50 µL 的血浆中有效、稳定地回收 RNA(此处以血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒为例,类别号:55000)。面板 A 显示,从 50 或 200 µL 的血浆中检测到的 microRNA 数量与 4 mL 的几乎相同。面板 B 是一张文氏图,显示在已确定的 microRNA 中,大多数都能在从 50 µL 到 4 mL 的所有血浆输入量中检测到。事实上,C 组的散点图显示,50 或 200 µL 血浆与 4 mL 血浆之间检测到的每种 microRNA 的相对表达水平都高度相关。
图 5.尿液和血浆中的 miRNA 图谱高度重叠。从三个不同的健康人身上采集血浆和中段尿液。使用 Norgen 的尿液外泌体 RNA 纯化试剂盒从每个尿液样本 20 mL 中分离出 RNA(类别号:47200),使用 Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒提取 200 µL 的每个血浆样本(类别号:55000)。然后使用 Illumina TruSeq 小 RNA 文库制备试剂盒生成小 RNA 文库,随后在 Illumina MiSeq 系统上进行测序。然后对同一人血浆和尿液中的映射 miRNA 列表进行比较。维恩图显示,每个人的尿液和血浆中的 miRNA 图谱高度重叠。
图 6.尿液中其他小 RNA 物种(Piwi-Interacting)的多样性增加。从三个不同的健康人身上采集血浆和中段尿液。使用 Norgen 的尿液外泌体 RNA 纯化试剂盒从每个尿液样本 20 mL 中分离出 RNA(类别号:47200),使用 Norgen 的血浆/血清 RNA 纯化迷你试剂盒提取 200 µL 的每个血浆样本(类别号:55000)。然后使用 Illumina TruSeq 小 RNA 文库制备试剂盒生成小 RNA 文库,随后在 Illumina MiSeq 系统上进行测序。上图显示,尿液中 piwi-interacting RNA(piRNA)的相对比例一直较高。
图 7.Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒能从 HeLa 细胞中分离出 miRNA,其多样性优于主要竞争对手。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒和 竞争对手 Q 的领先 miRNA 试剂盒从 100 万个 HeLa 细胞中分离出包括 miRNA 在内的总 RNA,并将其应用于 MiSeq 测序仪上的 Illumina Small RNA 下一代测序。面板 A 显示,诺健总 RNA 纯化试剂盒比竞争对手能回收更多的 miRNA。特别是,在不使用苯酚的情况下,只需 20 分钟的 RNA 样本制备时间,就能以更快、更简单的程序实现更高的多样性。B 部分是检测到的 miRNA 平均 RPM(每百万读数)的散点图,用于比较 Norgen 和竞争对手的 miRNA 回收率。Norgens 总 RNA 纯化试剂盒回收的具有较高 RPM 的 miRNA 数量明显较多,如插图和面板 C 所示。
图 8.从不同体积的血浆中纯化无细胞循环 RNA 和外泌体 RNA。Norgens Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit(类别号:56100)用于从 0.25 mL、0.75 mL 和 1.5 mL 血浆中纯化无细胞循环和外泌体 RNA。然后将 2 μL 纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以评估 (A) 家系 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的扩增情况。随着样本输入量的增加,5S rRNA 转录本和 miR-21 的平均 Ct 值呈线性下降趋势。
图 9.使用 Norgens Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit 从不断增加的血浆中纯化的 RNA 的线性度。Norgens Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit(类别号:56100)用于从 0.25 mL、0.7 mL 和 1.5 mL 血浆中纯化 RNA。然后将 2 μL 纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以评估来自不同血浆容量的 (A) 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的线性度。Norgens 血浆/血清 RNA 纯化 Midi 试剂盒能从 0.75 mL 血浆中回收 97% 的 5S rRNA 转录本和 miR-21 转录本,而 0.35 mL 血浆中的回收率仅为 97%。此外,与 0.75 mL 血浆中的含量相比,从 1.5 mL 血浆中回收了 95% 的 5S rRNA 转录本和 miR-21。
图 10.在检测人类 5S 转录本和 miR-21 时,确定血浆 RNA 样本中的抑制量。使用 Norgens Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit(类别号:56100)从 0.25 mL、0.75 mL 和 1.5 mL 血浆中分离 RNA。在 20 µL 反转录反应和 q 聚合酶链式反应扩增反应中使用的洗脱液体积不断增加(2、4 和 8 µL),以观察 Ct 值的下降情况。随着模板量的增加,Ct 值也会增加,这清楚地表明样本中存在聚合酶链式反应抑制剂。增加反转录反应中用作模板的聚合酶链式反应输入体积不会影响 q 聚合酶链式反应扩增产生的 (A) 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的 Ct 值。事实上,Ct 值会随着聚合酶链式反应输入量的增加而降低,这表明使用 Norgens 试剂盒从血浆中纯化的 RNA 不含通常存在于血浆中的常见抑制剂。
图 10.从不同体积的血浆中纯化无细胞循环 RNA 和外泌体 RNA。Norgens 血浆/血清 RNA 纯化 Maxi 试剂盒(类别号:56200)用于从 1.5 mL、3 mL 和 5 mL 血浆中纯化无细胞的循环和外泌体 RNA。然后将两毫升纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以评估 (A) 家管 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的扩增情况。随着样本输入量的增加,5S rRNA 转录本和 miR-21 的平均 Ct 值呈线性下降趋势。
图 11.使用 Norgens Plasma/Serum RNA Purification Maxi Kit(诺金血浆/血清 RNA 纯化 Maxi Kit)从不断增加的血浆中纯化的 RNA 的线性度。Norgens Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Exosomal RNA Purification Maxi Kit(类别号:56200)用于纯化 1.5 mL、3 mL 和 5 mL 血浆中的 RNA。然后将 2 μL 纯化的 RNA 用作 RT-q 聚合酶链式反应的模板,以评估来自不同血浆容量的 (A) 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的线性度。诺健血浆/血清 RNA 纯化 Maxi 试剂盒能够从 3 mL 血浆中回收 92% 的 5S rRNA 转录本,而 1.5 mL 血浆中的含量仅为 92%。此外,与 3 mL 血浆中的含量相比,从 5 mL 血浆中回收了 90% 的 5S rRNA 转录本。至于 miR-21,Norgens Plasma/Serum RNA Purification Maxi 试剂盒能从 3 mL 血浆中回收 91% 的 miR-21,而 1.5 mL 血浆中的含量为 91%。此外,相对于 3 mL 血浆中的含量,从 5 mL 血浆中回收了 90% 的 miR-21。
图 12.在检测人类 5S 转录本和 miR-21 时,确定血浆 RNA 样本中的抑制量。使用 Norgens Plasma/Serum RNA Purification Maxi Kit(类别号:56200)从 1.5 mL、3 mL 和 5 mL 血浆中分离 DNA。在 20 µL 反转录反应和 q 聚合酶链式反应扩增反应中使用的洗脱液体积不断增加(2、4 和 8 µL),以观察 Ct 值的下降情况。随着模板量的增加,Ct 值也会增加,这清楚地表明样本中存在聚合酶链式反应抑制剂。增加反转录反应中用作模板的聚合酶链式反应输入体积不会影响 q 聚合酶链式反应扩增产生的 (A) 5S rRNA 转录本和 (B) miR-21 的 Ct 值。事实上,随着聚合酶链式反应输入量的增加,Ct 值往往会降低,这表明使用 Norgens 试剂盒从血浆中纯化的 RNA 不含通常存在于血浆中的常见抑制剂。
试剂盒规格
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样本量范围 |
50 to 200 μL
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抗凝剂(用于血浆)*
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EDTA 或柠檬酸盐
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纯化的 RNA 大小 |
所有大小,包括小 RNA(< 200 nt)
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最小洗脱体积 |
10 μL
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最大洗脱体积 | 25 μL |
完成 10 次净化所需的时间 |
15-20 分钟
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平均产量** |
视样本而定
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*本试剂盒适用于从新鲜或冷冻血清或血浆中分离 RNA。不应使用肝素采血制备的血浆样本,因为肝素会严重干扰许多下游应用,如 RT-PCR。
**请查看第 7 页,了解血浆/血清平均产量和常用 RNA 定量方法。
储存条件和产品稳定性
所有溶液都应密封保存在室温下。该试剂盒自发货之日起 2 年内保持稳定。如果发现盐沉淀,建议将裂解缓冲液 A 在 60°C 下加热 20 分钟。