Kits d'isolement de l'ADN des selles

Figure 2. Qualité et concentration de l'ADN des selles mesurées par NanoDrop.Une concentration et une qualité élevées d'ADN ont été obtenues en utilisant le kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen à partir d'échantillons de selles frais ou conservés. Figure 2A : Échantillons de selles fraîches, figure 2B : Préserver les selles à l'aide de tubes de prélèvement et de conservation d'acide nucléique pour selles de Norgen (Cat. 45660).

Figure 3. Détection de l'ARNr 16S à partir de l'ADN de selles isolé à partir de 200 mg d'échantillons de selles fraîches à l'aide du kit d'isolement de l'ADN de selles de Norgen et du kit concurrent Q. La qualité de l'ADN a été confirmée par PCR en temps réel en utilisant 2 µL d'ADN de selles (le volume total de la réaction PCR était de 20 µL) pour détecter l'ARNr 16S de différents micro-organismes dans les échantillons de selles. La valeur Ct plus précoce avec les échantillons d'ADN de Norgen (lignes bleues) par rapport aux échantillons Qs du concurrent (lignes rouges) indique une meilleure qualité de l'ADN de selles pour les applications en aval. Figure 3A : Échantillon de selles fraîches, figure 3B : Préserver les selles à l'aide de tubes de prélèvement et de conservation d'acide nucléique pour selles de Norgen (Cat. 45660).

Figure 4. Détection de l'ARNr 5S à partir de l'ADN de selles isolé à partir de 200 mg d'échantillons de selles fraîches à l'aide du kit d'isolement de l'ADN de selles de Norgen et du kit Qs concurrent.La qualité de l'ADN a été confirmée par PCR en temps réel en utilisant 2 µL d'ADN de selles (le volume total de la réaction PCR était de 20 µL) pour détecter l'ARNr 5S de l'ADN eucaryote dans les échantillons de selles. La valeur Ct plus précoce avec les échantillons d'ADN de Norgen (lignes bleues) par rapport aux échantillons Q du concurrent (lignes rouges) indique une meilleure qualité d'ADN de selles pour les applications en aval. Figure 4A : Échantillon de selles fraîches, figure 4B : Selles préservés à l'aide de tubes de prélèvement et de conservation d'acide nucléique pour selles de Norgen (Cat. 45660).

Figure 5. Meilleure détection de l'ARNr 16S à partir de l'ADN isolé à l'aide du kit de conservation et d'isolement de l'ADN des selles de Norgen. Deux microlitres d'ADN de selles ont été utilisés dans un volume de réaction PCR de 20 µL. Les selles conservées à l'aide du conservateur d'ADN de selles de Norgen et isolées à l'aide du kit d'isolement d'ADN de selles de Norgen ont montré une meilleure détection du gène de l'ARNr 16S que les selles fraîches isolées à l'aide du concurrent Q.

Figure 6. Distribution de 10 microbiomes fécaux différents. A) Analyse en coordonnées principales de 10 microbiomes fécaux montrant des différences dans la distribution des classifications taxonomiques entre les échantillons jusqu'au niveau de la classe. B) Regroupement hiérarchique de 10 microbiomes fécaux sur la base de classifications au niveau du genre, y compris un diagramme à barres montrant l'abondance relative des classifications au niveau du genre pour chaque échantillon dans le dendrogramme.

Figure 7. ADN de haute qualité isolé à partir d'échantillons de selles conservés. L'ADN a été isolé à partir de 200 µL d'échantillons de selles conservés à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques). Pour l'évaluation, 10 µL de 75 µL d'élution ont été analysés sur un gel d'agarose 1X TAE 1,2 %. Les échantillons de selles ont été conservés dans des tubes de prélèvement et de transport d'acide nucléique de Norgen (Cat. 45630, 45660). M = échelle d'ADN HighRanger de Norgen (Cat. 11900).

Figure 8. Comparaison des ratios A260/280 et A260/230. L'ADN a été isolé à partir d'échantillons de selles de 200 mg à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques) et du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (format colonne). L'ADN purifié a ensuite été comparé pour les rapports A260/280 et A260/230. L'ADN isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques) (A, B et C) a montré une qualité d'ADN comparable à celle de l'ADN isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (méthode de la colonne), ce qui indique que la cohérence et la meilleure qualité d'ADN ont été générées par le kit d'isolement d'ADN des selles (système de billes magnétiques).

Figure 9. ADN de haute qualité confirmé par PCR en temps réel. L'ADN a été isolé à partir de 200 mg de selles à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques) et du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (format colonne). La qualité de l'ADN purifié a été évaluée en utilisant 8 L d'ADN de selles (le volume total de la réaction PCR était de 20 µL) pour détecter l'ARNr 16S à partir des différents échantillons de selles. Aucune inhibition de la PCR n'a été observée pour l'ADN isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques) (cercles bleus), comme pour l'ADN isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (méthode de la colonne) (cercles rouges), ce qui indique l'excellente cohérence de l'isolement et la qualité de l'ADN des selles pour les applications en aval.

Figure 10. Données métagénomiques 16S générées par Illumina MiSeq. L'ADN des selles a été isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques) à partir de 200 mg de selles de donneurs sains, et les microbiomes des selles ont été séquencés avec succès par Illumina MiSeq.

Figure 11. ADN de haute qualité isolé à partir d'échantillons de selles conservés. L'ADN a été isolé à partir de 200 µL d'échantillons de selles conservés à l'aide du kit 96 puits pour l'isolement de l'ADN des selles de Norgen (système de billes magnétiques). Pour l'évaluation, 10 µL de 75 µL d'élution ont été passés sur un gel d'agarose 1X TAE 1,2 %. M = échelle d'ADN HighRanger de Norgens (Cat. 11900).

Figure 12. ADN de haute qualité confirmé par PCR en temps réel.. L'ADN a été isolé à partir de 200 mg de selles à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles à 96 puits de Norgen (système de billes magnétiques). La qualité de l'ADN purifié a été évaluée en utilisant 2 µL d'ADN de selles (le volume total de la réaction PCR était de 20 µL) pour détecter l'ARNr 16S de l'échantillon de selles. Aucune inhibition de la PCR n'a été observée à partir de l'ADN isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles à 96 puits de Norgen (système de billes magnétiques), ce qui indique l'excellente cohérence de l'isolement et la haute qualité de l'ADN des selles pour les applications en aval.