Système de collecte et de préservation des écouvillons fécaux

Figure 2. Integrity of Total Stool DNA and RNA Isolated from Preserved Stool Samples. DNA and RNA were isolated from 200 µL of preserved stool from 4 different donors (lanes A to D) stored at room temperature at the indicated time points (DNA at 27 months and RNA at 7 days) using Norgen's Stool Nucleic Acid Isolation Kit (Cat# 45600). Next, 10 µL from the 75 µL eluted nucleic acid was loaded onto a gel for visual analysis. High integrity stool DNA was isolated from preserved stool samples that were stored at room temperature for 27 months, and high integrity RNA was isolated from stool samples stored for 7 days at ambient temperature. Lane M is Norgen's HighRanger 1 kb DNA Ladder (Cat. 11900).

Figure 3. Monitoring the DNA stability of Adenovirus (Ad5subE1) Spiked into Preserved Stool Samples using TaqMan Real-Time PCR Assay. Preserved stool samples were spiked with 6 x 10⁹ pfμ/mL of Adenovirus, and 200 µL samples were removed at the indicated time points. The stool DNA was then isolated using Norgen's Stool DNA Isolation Kit (Cat. 27600). Next, 2 µL of DNA template from each 50 µL of elution was used in a 20 µL PCR reaction to detect the Adenovirus DNA. The stool preservative was shown to stabilize Adenovirus DNA up to 21 weeks at ambient temperature, indicating that Norgen's Fecal Swab Collection and Preservation System provides a safe and convenient sample transportation system.

Figure 4. Regroupement hiérarchique des échantillons de selles au niveau du phylum dans différentes conditions de stockage. La composition microbienne des échantillons de selles conservés dans les tubes de prélèvement et de conservation de l'acide nucléique des selles de Norgen (Cat. 45630, 45660) ne diffèrent pas significativement de ceux des témoins (selles fraîches du jour 0 à la RT) sur une période de 2 jours, tandis que les échantillons de selles non conservés ont montré une distance dans le dendrogramme par rapport au profil original des selles.

Figure 5. Différence dans les 5 principaux micro-organismes abondants au niveau de l'embranchement par rapport aux selles fraîches (jour 0).. L'abondance des Firmicuties, des Bacteroidetes et des protéobactéries de l'échantillon de selles conservé était plus élevée que celle des selles fraîches non conservées (NP) après 2 jours de stockage à température ambiante, ce qui indique que l'originalité du profil des micro-organismes de l'échantillon conservé est beaucoup plus proche de celle de l'échantillon de selles fraîches (jour 0).

Figure 6. Abondance relative des genres bactériens entre les échantillons de selles conservés et non conservés à température ambiante pendant 2 jours. Préserver l'échantillon de selles en utilisant les tubes de prélèvement et de conservation de l'acide nucléique de Norgen (Cat. 45630, 45660) ont montré une relativité proche de l'échantillon de selles fraîches (jour 0).

Figure 7. Corrélation entre les lectures métagénomiques bactériennes en double utilisant (A) des selles fraîches (jour 0) et des selles conservées à la température ambiante pendant 2 jours et (B) des selles fraîches (jour 0) et des selles non conservées à la température ambiante pendant 2 jours. Un R2 plus important a été observé pour les selles fraîches (jour 0) et les selles conservées, ce qui suggère une plus grande cohérence entre les échantillons de selles fraîches et les échantillons de selles conservées.